生态监管领域智慧环保的运用主要有生态红线监管、自然保护区监管、生物多样性监管等。全面利用卫星遥感、云计算、地理信息系统，建立多尺度、多时相、天/空/地一体化的生态监管信息数据资源库。利用无人机航空遥感和地面生态观测的数据快速获取能力，开展生态保护红线巡查、人类活动监测、生态格局、生态系统质量、生态风险监管、生态资产统计核算、生态保护成效评估、移动核查与执法等领域的业务应用，提升国家生态监管水平。
生态红线是我国“三线一单”环境管理模式的重要组成部分，是未来生态监管体系建设的重要方向。智慧环保在生态监管领域具有较大应用前景的业务有：生态红线的划定、勘定与建设项目审批、规划环评等业务审批相结合；从生态环境质量等维度对生态红线进行科学评估。生态环境部卫星环境监测应用中心实施的多种业务化系统，标志着基于卫星遥感的生态监管体系建设取得了阶段性成果。
智慧环保资源交易的应用。
全方位的环境保护产业和互联网技术的结合，促进了“互联网+”环保领域的深入应用，产生了废物在线交易、环保技术线上对接、企业网上排污权交易等新兴业态。环境保护产业的发展，要求优化技术路线、商业模式、经营方式，推动产业技术进步和环保产业的颠覆性变革。
智慧环保进一步鼓励网络企业参与建立城市垃圾回收平台，促进再生资源回收模式创新：利用电子标签、二维码等物联网技术追踪重点电子废物流向，实施各类产业园区废弃物信息平台建设；推动各类产业园区废弃物信息平台建设；推动再生资源回收模式创新；利用电子标签、二维码等物联网技术进行跟踪；以推进主要污染物总量减排为重点，探索企业网上排污权交易试点；开展碳排放权交易市场先行试，通过循环经济信息交流平台推动企业节能低碳成果的在线展示和经验推广。以示范工程的推动，加快垃圾在线交易的全面实施。
